北交所作为国内资本市场为创新型中小企业服务的证券交易所，其交易佣金与收费标准是投资者进行交易决策前必须了解的核心信息。交易费用主要构成包括交易佣金、印花税以及过户费等部分，而佣金部分通常是投资者通过与证券公司协商来确定的相对灵活的费用。
股票交易佣金是投资者在证券公司进行交易时向其支付的费用，这是证券公司或券商平台的主要收入来源之一。北交所的股票交易佣金实行双向收取，即在买入和卖出股票时都需要支付。在费率标准上，按照行业惯例，通常默认佣金费率在成交金额的万分之三左右，但这并非固定不变的，投资者完全可以与证券公司进行沟通和协商。不同券商的佣金收费标准是存在差异的，费率最高不得超过成交金额的千分之三，并且有单笔最低收费5元的惯例，若计算出的佣金金额不足5元也会按照5元收取。
除了券商佣金，投资者还需承担两项由国家有关机构统一征收的税费。一是印花税，仅在卖出股票时单向收取，按照成交金额的千分之零点五来收取，此税收固定并由券商代扣后上缴。二是过户费，由证券登记结算机构收取，用于股票过户登记，这项费用为双向收取，一般按照成交金额的十万分之一来计算。债券与基金交易通常免除印花税。
北交所整体的收费结构与沪深交易所有相似之处，但也存在一些自身特点。其交易经手费按成交金额的万分之一点二五双向收取，并已在前期政策中减半征收。对于投资者而言，获取更优惠费率的有效方法是联系券商的线上客户经理进行主动协商。客户经理拥有一定的调佣权限，可以根据投资者的资金规模、交易活跃度等情况，在自身运营成本允许的范围内，为投资者申请到比官方默认费率更低的佣金方案，最低甚至可以申请到成本价。
